整體防洪治理與管理台灣河川防洪策略需考慮各河川自然條件，針對河川特性，現有保護情形及防洪問題，及保育、治導、管理等整體考量，採治水與防砂兼顧，主要工作包括：
推動流域整體規劃工作之整合。
加強上游集水治理工作。
加速興建河川中、下游防洪工程。
加強低水流路整治及河川空間美化工作。
加強現有防洪工程之維護。
建立水災預警報系統。
加強河川管理工作：
杜絕河川砂石盜濫採，推動砂石採取整體管理改善計畫，輔導砂石業者分區分段配合政府河川疏浚整治計畫作有秩序之開採，以維護河防安全。
促進河川土地合法使用與多目標空間利用。
嚴加取締河川區域違法行為。
加強地方政府河川管理執行能力。
推動我愛河川教育及宣導工作及鼓勵民間參與河川管理及防汛搶險工作。
依此整治策略，前經濟部正推動本院核定之「加強河川管理方案」及「河川砂石濫採行為改進方案」，並與環保署配合執行「河川行水區鄉鎮市垃圾棄置場處置計畫方案」。