因應107年汛期來臨，水利署第六河川局自106年11月底汛期結束後，便積極趕辦淤積河段疏濬、河道整理工程，除尚在施工工程持續進行外，目前已完成曾文溪鐵路橋上游、二溪大橋上游、鹽水溪高鐵橋上游、二仁溪石安橋上下游等河段之疏濬、河道整理工程，計完成清疏數量達56萬立方公尺，對臺南市官田區、大內區、新化區、永康區、歸仁區及高雄市阿蓮區等河川沿岸地區之民眾生命財產安全保障，實有莫大助益。
98年莫拉克風災造成南部地區重大水患，並使河川嚴重淤積，為利河川通洪，六河局於風災後積極辦理轄管河川之疏濬工程，迄今8年來，已於曾文溪、鹽水溪、二仁溪、阿公店溪及其支流完成約1,500萬立方公尺之疏濬量，有效疏通河道，並降低河川沿岸淹水風險，確保民眾生命財產安全。
大臺南、大高雄地區於縣市合併後發展迅速，科學園區、工業區帶來大量人口移入，使得河川沿岸人口愈趨稠密，然而近年來氣候變遷，「短延時、強降雨」常導致山坡地大量土石崩塌，造成河道淤積，為維護民眾生命財產安全，疏濬工程已成為常態性的工作，六河局於107年將持續計畫辦理曾文溪大內橋、鹽水溪大昌橋、新灣橋、二仁溪南雄橋、菜寮溪民生橋、三角潭橋等河段之疏濬工程，數量約109萬立方公尺（約78,000輛砂石車載運量），將可再大大提升通洪效率，減低豪大雨致災之機率。
六河局表示，目前疏濬工程雖然於工區均設置地磅、洗車台，並配合灑水車、洗街車之執行，有效降低對交通、空氣品質的衝擊，但仍難免對當地居民生活環境有所影響，六河局感謝這段時間當地民眾及地方政府的支持與配合，才得使疏濬工程順利完成，達成所定目標。
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