有關報載市議員質疑本局辦理之「龜子港排水出口閘門新建工程」距離大海還有一大段距離，在此設置閘門有何意義？該閘門係台南市政府提報要求辦理之工程，位於龜子港排水出口，其設置目的在防止急水溪洪水倒灌進龜子港排水，而溢淹該排水沿岸土地，功能並非在防止海水倒灌。
該工程係委託顧問公司測設及監造，施工亦依設計圖說施工，前依規定程序完成驗收，去年8月間，因颱風、豪雨造成其上游德元埤多次放水，而造成擋土牆位移，伴隨上層擋土牆、堤頂及防汛庫房傾斜或下陷，本局於當時立即請原施工廠商進行緊急搶險，於擋土牆前拋放混凝土塊、塊石、堤頂灌漿及增設地錨固定上層擋土牆，截至目前為止已相當穩定。水利署政風室接獲災損訊息即組成專案小組至工地勘查及進行品質鑽心抽驗，其結果皆合格。其災害原因由設計單位委託台灣省土木技師公會鑑定，本局將於相關責任釐清後，若涉及廠商責任，將依契約規定辦理後續求償事宜。
因防汛在即，本局考量急迫性，將協商該排水管理單位台南市政府先協助辦理後續修繕，以維汛期安全。